Compétences

Informatique

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 Systèmes d’exploitation

  • Systèmes Microsoft Windows
  • Systèmes Linux (Red Hat, Fedora Core)
  • Mac OS X
  • Unix

 

Langages de Programmation

  • Python
  • Perl
  • UNIX Shell / Bash
  • JAVA (notions)
  • C (notions)

 

 Développement Web

 Respect des standards web définis par le W3C.
Forte sensibilisation aux problèmes de sécurité liée au web (cookie, sessions, failles XSS, injections SQL, upload, .htaccess, etc.).

  • PHP 5
  • HTML 5 / XHTML
  • JavaScript, DOM, Ajax, JQuery
  • CSS 3
  • XML
  • SQL
  • Apache – Installation/Configuration sous Unix

 

 Systèmes de Gestion de Bases de Données Relationnelles

  • MySQL
  • SyBase (dans le cadre de la formation universitaire)
  • Méthodes d’analyse : MERISE

 

 Environnements

  • Eclipse
  • Editeurs Vim, Gvim

 

Gestionnaire de version

  • Subversion (SVN)

 

 Bugtrackers

  • Trac
  • Redmine

 

Virtualisation

  • ProxMox

 

 Systèmes de publication de contenus

  • SPIP
  • Joomla
  • WordPress

 

Compétences complémentaires

  • Référencement web
  • Ergonomie
  • Web design
  • Solides compétences pratiques en maintenance informatique (hardware).

Biotechnologies

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 Analyses génomiques

  • Génomique comparative de génomes bactériens, Synténies.
  • Annotation syntaxique et fonctionnelle de gènes
  • Métabolisme Bactérien : prédiction et comparaison de réseaux métaboliques, ressources de données métaboliques (KEGG, BioCyc, etc.).
  • Principaux formats de données génomiques (Fasta, GenBank, EMBL, etc.)
  • Ressources de données protéiques / enzymatiques (Uniprot, TrEMBL, Interpro, FigFam, COG, PRIAM, HAMAP, etc.)
  • Technologies « Next Generation Sequencing » (notions)
  • Analyses de données d’évolution, SNPs / InDels (notions)
  • Analyse de données RNA-Seq (notions)

 

 Génie génétique

  • Technique « Polymerase Chain Reaction » (PCR)
  • Purification d’ADN
  • Extraction d’ADN sur gel
  • Typage d’éléments d’insertion
  • Analyse de chromatogrammes

 

 Purification et dosage de protéines

  • Electrophorèse
  • Chromatographie
  • Enzymologie

 

 Traitements et analyses informatiques de données biologiques

  • Développement et gestion de bases de données biologiques.
  • Développement d’interfaces Web dynamiques.
  • Développement et intégration de scripts PHP, Perl, bash appliqués au traitement de séquences nucléiques et protéiques.
  • Alignements multiples de séquences nucléiques / protéiques.

Langues

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Français (langue maternelle)

  • Très bon niveau
  • Lu, écrit et parlé correctement

 

Anglais

  • Bon niveau (Formations sur l’utilisation de la plate-forme MicroScope en anglais auprès de techniciens, ingénieurs ou chercheurs en génomique)
  • Lu, écrit, parlé

Organisation & Relationnel

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  • Autonomietravail en équipe et adaptabilité acquis au cours de mes expériences professionnelles.
  • Esprit d’initiative et capacités d’innovation attenants aux métiers de l’ingénierie.
  • Perfectionnismerigueur professionnelle et esprit méthodique inhérents aux métiers des sciences.
  • Curiosité d’esprit liée à ma passion des nouvelles technologies et des sciences.
  • Pédagogie, mise en valeur dans le cadre des formations professionnelles dispensées sur la plateforme MicroScope.
  • Écoute et prise en compte des demandes clients et utilisateurs.
  • Sensibilisation à l’application des normes ISO 9001 dans le cadre des activités de recherche, développement et services (le système de gestion par la qualité du LABGeMa reçu la certification ISO 9001 en février 2012).

CV Grégory SALVIGNOL | Bioinformatique & Développements Web
   
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