Formation Universitaire

DESS Ressources Génomiques et Traitements Informatiques

Faculté des Sciences Nancy I, Université Henri Poincaré

Voir plus


Logo Université de LorraineMention Bien.
Faculté des Sciences Nancy I, Université Henri Poincaré.
Sous la direction du Professeur Pierre LEBLOND.

 Principaux Enseignements

  • Programmation et concepts en informatique.
  • Bases de données biologiques.
  • Traitement informatique des séquences nucléiques et protéiques.
  • Cartographie des génomes.
  • Séquençage des acides nucléiques.
  • Analyse et comparaison de séquences.
  • Méthodes d’étude globale de l’expression des génomes, et génétique inverse.
  • Prédiction de structures 3D de protéines et d’acides nucléiques.
  • Dynamique des génomes.
  • Evolution et phylogénie.
  • Génomique humaine, pharmacogénomique, épidémiologie.
  • Génomique virale

 

 Projet Tutoré

Développement d’un service web de recherche bibliographique appliqué au polymorphisme génétique, dans la pression sanguine et l’hypertension, chez l’Homme : « From Genomes to Bibliomes ».

 

 Stage de 7 mois à l’Institut Pasteur

Stage réalisé sous la direction du Professeur Antoine DANCHIN.
Développement d’une Base de Données dédiée à la connaissance génétique des Bactériophages et interrogeable via Internet, d’après le modèle GenoList.

  • Conception du schéma relationnel de la base.
  • Programmation de la structure de la base de données.
  • Identification, extraction et implémentation des données biologiques d’intérêt.
  • Adaptation de l’interface graphique pour l’interrogation de la base.
  • Paramétrages du système d’exploitation et des outils informatiques requis.
  • Collaboration avec un étudiant chinois en thèse : pratique de l’anglais.
  • Rédaction d’un mémoire de DESS.

 

 Matériel & Méthode

  • MacOS X, Interface UNIX.
  • Langages :
    • Unix
    • Perl : CGI, BioPerl, Perl DBI/DBD
    • SQL
    • HTML
    • JavaScript
  • Système de Gestion de Base de Données Relationnelles : MySQL
  • Méthode d’analyse : MERISE
  • Serveur Web : Apache
  • Données biologiques : National Center for Biotechnology Information


Maîtrise de Biologie Cellulaire et Physiologie

UFR Sciences et Techniques de Rouen

Voir plus


Logo Université de RouenMention Assez Bien.
UFR Sciences et Techniques de Rouen, Place Émile Blondel, 76821 Mont-Saint-Aignan Cedex.
Sous la direction du Professeur Marek LAMACZ.

 Principaux Enseignements

  • Physiologie animale
  • Physiologie végétale
  • Physiologie cellulaire et moléculaire
  • Métabolisme et régulation
  • Génétique moléculaire
  • Initiation à la bioinformatique

 

 Stage de 5 mois à l’Institut de Génétique et Microbiologie

Séquençage et étude de régions minisatellites chez Yersinia pestis.

  • Technique PCR
  • Purification d’ADN
  • Extraction d’ADN sur gel
  • Typage d’éléments d’insertion
  • Analyse de chromatogrammes
  • Utilisation d’outils informatiques de traitement et d’analyse :
    • PHRAP/PHRED
    • « Tandem Repeat Finder »
    • « Database for Tandem Repeat Investigations »
    • CLUSTALW
    • ALIGNn
    • BLASTn
  • Rédaction d’un mémoire de Maîtrise

 

Co-signataire publication

C. Pourcel, G. Salvignol and G. Vergnaud
« CRISPR elements in Yersinia pestis acquire new repeats by preferential uptake of bacteriophage DNA, and provide additional tools for evolutionary studies »
Microbiology ; 151 : 653-663 ; Mars 2005

Licence de Biologie Cellulaire et Physiologie

UFR Sciences et Techniques de Rouen

Voir plus

Logo Université de RouenUFR Sciences et Techniques de Rouen,
Place Émile Blondel
76821 Mont-Saint-Aignan Cedex.

Principaux Enseignements

  • Physiologie animale
  • Physiologie végétale
  • Physiologie cellulaire et moléculaire
  • Métabolisme et régulation
  • Génétique moléculaire

DEUG Sciences de la Vie

UFR Sciences et Techniques de Rouen

Voir plus

Logo Université de RouenUFR Sciences et Techniques de Rouen, Place Émile Blondel
76821 Mont-Saint-Aignan Cedex.

DEUG Physique-Chimie

UFR Sciences et Techniques de Rouen

Voir plus

Logo Université de RouenUFR Sciences et Techniques de Rouen target=”_blank”,
Place Émile Blondel
76821 Mont-Saint-Aignan Cedex.

Préparation aux grandes écoles – PCSI

Lycée Aristide Briand, Evreux

Voir plus

Logo Lycée Aristide Briand EvreuxLycée Aristide Briand,
EVREUX.
Math. Sup. – Physique, Chimie, Sciences de l’Ingénieur (PCSI)

CV Grégory SALVIGNOL | Bioinformatique & Développements Web
   
Do NOT follow this link or you will be banned from the site!